Joaquín llegó cantera rojiblanca, en la que empezó con 16 años procedente de su Málaga natal. En la primera temporada con el Atlético anotó 17 goles en Liga Nacional, y en División de Honor Juvenil firmó 8. En la 2017/2018 su aportación fue vital para el triplete del Juvenil A logrado por el club madrileño en el campeonato liguero, la Copa del Rey y la Copa de Campeones. Un rendimiento que le hizo dar el salto al Atlético de Madrid B en la categoría de bronce del fútbol español, dónde jugó un total de 29 encuentros de Segunda B, 24 de ellos como titular más dos de la fase de ascenso a LaLiga123, firmando un total de siete goles.