Juan Villar llegó al Altoaragón tras formar parte del Almería en las últimas dos campañas, acumulando medio centenar de encuentros tanto en liga como en competición copera. Antes, fue jugador del Osasuna, donde debutó en Primera División. De hecho, atesora dos ascensos a la máxima categoría, con el club navarro y el más reciente, con el Almería.

El ariete también ha pasado por más equipos del panorama nacional: Tenerife, Rayo Vallecano, Cádiz o Real Valladolid completan su nutrida trayectoria. Asimismo, en los dos últimos equipos fue donde logró sus mejores registros goleadores. Con la camiseta del Cádiz, en Segunda B, logró 43 tantos en tres temporadas. Esto le permitió fichar por el club pucelano, con el que hizo 35 goles en dos temporadas en la división de plata.